Axygen Product Selection Guide 96-97(94-95)

概要

  1. ジェノミクスサンプル調整用キット
  1. 96
  2. 97

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96ジェノミクスサンプル調製用キットサンプル調製用キットAxygen®AxyPrepMAGダイクリーンキット余剰のダイターミネーターの除去はシークエンシングを行う前の重要なステップです。シークエンシングに余剰なダイを持ちこむとダイがかたまりとなり、過剰なノイズの原因や塩基配列読み取りの失敗、シークエンシング解析そのものが失敗する可能性があります。AxyPrepMAGダイクリーンキットは、サンガー法を用いたシークエンス反応液から余剰のダイターミネーターを除去することができます。精製のプロトコールは主に、結合、洗浄、溶出の3つのステップからなり、遠心分離や濾過作業を踏むことなく、シークエンス反応を行ったPCRプレート上で直接行うことができます。 ◗時間とコストの節約:QVスコアを高く保ちつつ、BigDye®を大幅に節約できます。 ◗BigDyeシグナルエンハンサーバッファーなどのコストが不要です。 ◗高いS/N比により長い読み取り枠と高いQVスコアを実現しています。 ◗以下のサンガー法を用いたシークエンサーで生成されたシークエンス反応液のクリンナップに適当です。-ABIPrism3730、3730xl、3700、3130、3130xl、3100-GEHealthcareMegaBACE ◗96サンプルを25分程度でクリンナップできる簡潔なプロトコールです。 ◗遠心分離、濾過は不要です。アプリケーションw ‌サンガー法を用いたシークエンシングシグナルエンハンサーバッファーなしでBigDyeの節約を達成上の2つのグラフから、AxyPrepMAGダイクリーンを使用すれば28倍希釈まではBigDyeシグナルエンハンサーバッファーは必要がないことが示唆されました。各シークエンス反応は、BigDyev3.1Kitから250ngのpGEM3ZF(+)コントロールプラスミド、3.2pmolのM13(-21)プライマー、グラフに記載された希釈率のBigDyev3.110µLを用いてABI3730xlにて解析しました。BigDyeDilutionBigDyeDilution100090080070060050040030020010001000900800700600500400300200100012121616202024242828カタログ番号製品名入数メーカー希望小売価格(円)MAG-DYECL-1AxyPrepMAGダイクリーンキット1mL100反応分8,500MAG-DYECL-5AxyPrepMAGダイクリーンキット5mL500反応分36,600MAG-DYECL-50AxyPrepMAGダイクリーンキット50mL5,000反応分185,500MAG-DYECL-250AxyPrepMAGダイクリーンキット250mL25,000反応分742,200シークエンス反応液をAxyPrepMAGダイクリーンでクリンナップしてシークエンシングした際のQV20以上の読み取り枠スコアシークエンス反応液をAxyPrepMAGダイクリーンでクリンナップして且つBigDyeシグナルエンハンサーバッファーを加えてシークエンシングした際のQV20以上の読み取り枠スコアQV20以上の有効読み取り枠(bp)QV20以上の有効読み取り枠(bp)
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97ジェノミクスサンプル調製用キットサンプル調製用キットAxygen®AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキット次世代シークエンシングにおいて、DNAの断片化の後、ライブラリー構築プロセスではプラットフォームに関わらずほとんどの場合フラグメントサイズの選択が必要です。フラグメント選択で高い収量を得る事は、シークエンシングのバイアスを軽減するために重要な要素です。AxyPrepMAGフラグメントセレクト-IキットはIllumina®次世代シークエンシングプラットフォームのフラグメントサイズセレクションに最適化しており、ライブラリー構築ワークフローを簡略化します。AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキットはマグネティックビーズ技術によって、多様な次世代シークエンシングプラットフォームに最適化したDNAサイズセレクションを迅速・ハイスループットで行えます。 ◗Illumina次世代シークエンサーに最適化したフラグメントセレクト技術です。 ◗汎用性があり、フレキシブルなシークエンシング用フラグメントサイズ選択が可能です。 ◗ゲルは不要です。 ◗プライマーダイマーを効率よく除去:追加のクリンナップが不要です。 ◗手動または自動化システムで使用可能です。 ◗チューブ、96ウェルプレート、384ウェルプレートで使用可能です。 ◗遠心分離、ろ過は不要です。アプリケーションw ‌Illumina次世代シークエンシングプラットフォームw ライブラリーの構築AxygenMAGフラグメントセレクトキットを使用し得られたフラグメントをAgilentBioAnalyzerHighSensitivityDNAChipで解析。DNAフラグメントセレクトキットの割合の違いにより異なるフラグメントサイズを示した。カタログ番号製品名入数メーカー希望小売価格(円)MAG-FRAG-I-1AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキット1mL7反応分6,300MAG-FRAG-I-5AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキット5mL40反応分22,300MAG-FRAG-I-50AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキット50mL380反応分136,800MAG-FRAG-I-250AxyPrepMAGフラグメントセレクト-Iキット250mL1,900反応分427,400

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